Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
APOC4-APOC2K7ER74 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
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