Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
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