Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

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Length 881 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
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PKP2Q99959 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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PKP2Q99959 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PKP2Q99959 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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PKP2Q99959 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
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PKP2Q99959 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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PKP2Q99959 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PKP2Q99959 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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