Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
ZBED3Q96IU2 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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