Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
ZNF239Q16600 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF239Q16600 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
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