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Protein–RNA interactions for Protein: Q15532
SS18, Protein SSXT, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SS18
Q15532
RNU6-719P-201
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
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BASIC
-0.36
□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
MIR3144-201
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79 nt
BASIC
-0.36
□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
MIR548Z-201
ENST00000584743
97 nt
BASIC
-0.36
□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
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BASIC
-0.36
□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
MTND5P18-201
ENST00000445624
1801 nt
BASIC
-0.36
□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
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Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
SNORA3B-201
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
MIR548X2-201
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SS18
Q15532
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ENST00000583346
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TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
MIR3140-201
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BASIC
-0.37
□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
MIR6851-201
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67 nt
BASIC
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
DLEU2_3.1-201
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73 nt
BASIC
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SS18
Q15532
MIR409-201
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BASIC
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SS18
Q15532
Y_RNA.353-201
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
MTND4LP9-201
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SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
RNU6-1271P-201
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105 nt
BASIC
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
AL513043.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
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183 nt
BASIC
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SS18
Q15532
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163 nt
BASIC
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SS18
Q15532
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167 nt
BASIC
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SS18
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SS18
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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□□□□□ -2.47
SS18
Q15532
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Q15532
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SS18
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BASIC
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SS18
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SS18
Q15532
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SS18
Q15532
RNU6-973P-201
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SS18
Q15532
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Q15532
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Q15532
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SS18
Q15532
IL6ST-207
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TSL 1 (best)
BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
SCARNA20.2-201
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
MIR4777-201
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BASIC
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SS18
Q15532
AC103810.7-201
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BASIC
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SS18
Q15532
MIR6773-201
ENST00000612812
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BASIC
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SS18
Q15532
RNY3P2-201
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
Y_RNA.506-201
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102 nt
BASIC
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SS18
Q15532
RNU6-901P-201
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BASIC
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SS18
Q15532
MIRLET7B-201
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BASIC
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□□□□□ -2.48
SS18
Q15532
MT-TQ-201
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.48
SS18
Q15532
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SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
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□□□□□ -2.48
SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.48
SS18
Q15532
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BASIC
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SS18
Q15532
RNY1P7-201
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□□□□□ -2.48
SS18
Q15532
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BASIC
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□□□□□ -2.48
SS18
Q15532
U3.27-201
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BASIC
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□□□□□ -2.48
SS18
Q15532
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SS18
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Y_RNA.659-201
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BASIC
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SS18
Q15532
RNU7-200P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.48
SS18
Q15532
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SS18
Q15532
Y_RNA.700-201
ENST00000516806
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BASIC
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Q15532
RNU6-881P-201
ENST00000516813
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SS18
Q15532
RNU6-971P-201
ENST00000516920
106 nt
BASIC
-0.44
□□□□□ -2.48
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