Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SEC23AQ15436 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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SEC23AQ15436 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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SEC23AQ15436 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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SEC23AQ15436 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SEC23AQ15436 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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SEC23AQ15436 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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SEC23AQ15436 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SEC23AQ15436 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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SEC23AQ15436 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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SEC23AQ15436 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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SEC23AQ15436 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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SEC23AQ15436 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SEC23AQ15436 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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