Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-3.36□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-3.37□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-3.38□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-3.39□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-3.4□□□□□ -2.95
SMCO1Q147U7 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-3.41□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-3.41□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-3.42□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-3.43□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-3.44□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-3.45□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC-3.46□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-3.47□□□□□ -2.96
SMCO1Q147U7 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-3.48□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-3.49□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.5□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-3.51□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-3.52□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.52□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-3.53□□□□□ -2.97
SMCO1Q147U7 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
SMCO1Q147U7 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-3.54□□□□□ -2.98
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