Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
DDX39BQ13838 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
DDX39BQ13838 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.3□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.32□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
DDX39BQ13838 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
DDX39BQ13838 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
DDX39BQ13838 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
DDX39BQ13838 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171 ms