Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.47□□□□□ -2.33
SNAPC2Q13487 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SNAPC2Q13487 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SNAPC2Q13487 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SNAPC2Q13487 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms