Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
MKRN4PQ13434 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.55□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MKRN4PQ13434 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
MKRN4PQ13434 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
MKRN4PQ13434 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
MKRN4PQ13434 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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