Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.42
GTF3C1Q12789 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
GTF3C1Q12789 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
GTF3C1Q12789 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.1 ms