Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CRXO43186 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CRXO43186 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CRXO43186 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CRXO43186 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CRXO43186 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CRXO43186 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CRXO43186 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CRXO43186 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CRXO43186 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CRXO43186 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CRXO43186 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CRXO43186 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CRXO43186 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CRXO43186 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CRXO43186 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CRXO43186 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CRXO43186 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CRXO43186 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CRXO43186 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CRXO43186 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CRXO43186 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CRXO43186 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CRXO43186 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CRXO43186 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CRXO43186 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CRXO43186 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CRXO43186 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CRXO43186 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CRXO43186 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CRXO43186 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CRXO43186 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CRXO43186 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CRXO43186 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CRXO43186 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
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