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Protein–RNA interactions for Protein: O14815
CAPN9, Calpain-9, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CAPN9
O14815
SNORD115-44-201
ENST00000365391
82 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-132P-201
ENST00000383863
107 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
MIR519E-201
ENST00000385075
84 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6ATAC11P-201
ENST00000408541
125 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
MIR2113-201
ENST00000459007
91 nt
BASIC
0.4
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
MIR103A1-201
ENST00000362165
78 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
MIRLET7F1-201
ENST00000362202
87 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-664P-201
ENST00000362381
107 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
SNORD101-201
ENST00000384027
73 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNY1P7-201
ENST00000384743
110 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNA5SP299-201
ENST00000391203
116 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
Y_RNA.609-201
ENST00000410669
89 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-65P-201
ENST00000516332
98 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
MIR4536-1-201
ENST00000583537
88 nt
BASIC
0.39
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
AC090625.1-201
ENST00000357130
210 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
MIR617-201
ENST00000385030
97 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU2-59P-201
ENST00000410482
191 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-519P-201
ENST00000410590
108 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
SNORA70.25-201
ENST00000612741
95 nt
BASIC
0.38
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
AC093423.1-201
ENST00000440817
142 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNA5SP484-201
ENST00000458857
111 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
MIR3064-201
ENST00000581130
66 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
CYP19A1-220
ENST00000613097
123 nt
TSL 5
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
Evf-2_5p.1-201
ENST00000614213
142 nt
BASIC
0.37
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNY4P3-201
ENST00000365254
95 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-49P-201
ENST00000384256
107 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-30P-201
ENST00000384561
107 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-1232P-201
ENST00000516299
86 nt
BASIC
0.36
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNA5SP98-201
ENST00000363158
137 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-1131P-201
ENST00000364955
107 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
SNORA2A-201
ENST00000383885
135 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
Y_RNA.423-201
ENST00000384057
113 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNA5SP292-201
ENST00000390974
118 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNU6-863P-201
ENST00000515989
104 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
RNA5SP134-201
ENST00000516492
96 nt
BASIC
0.35
□□□□□ -2.35
CAPN9
O14815
Y_RNA.185-201
ENST00000363894
100 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU1-141P-201
ENST00000364623
158 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-935P-201
ENST00000410371
100 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
AC104996.3-201
ENST00000590718
94 nt
BASIC
0.34
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
SNORD115-27-201
ENST00000364430
82 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-811P-201
ENST00000384069
107 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
NAMPTP3-201
ENST00000569273
224 nt
BASIC
0.33
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU4-32P-201
ENST00000363404
141 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-509P-201
ENST00000363519
107 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
Y_RNA.239-201
ENST00000364444
113 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
SNORD90-201
ENST00000391145
111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
IL6ST-207
ENST00000396816
168 nt
TSL 1 (best)
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU7-74P-201
ENST00000459104
62 nt
BASIC
0.32
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
AC073869.9-201
ENST00000641610
120 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-1298P-201
ENST00000362456
101 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-815P-201
ENST00000384080
113 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
Y_RNA.491-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR451A-201
ENST00000385059
72 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNY4P30-201
ENST00000410216
95 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
Z95118.1-201
ENST00000421372
247 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR4668-201
ENST00000582284
70 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
DLEU2_3.1-201
ENST00000620005
73 nt
BASIC
0.31
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
Y_RNA.220-201
ENST00000364244
109 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-219P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR760-201
ENST00000390220
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BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR548U-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
AC108740.1-201
ENST00000498629
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BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
SNORA18.5-201
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BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
Y_RNA.694-201
ENST00000516677
117 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-267P-201
ENST00000516714
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-844P-201
ENST00000517175
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR4802-201
ENST00000581881
80 nt
BASIC
0.3
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
HOTAIR_3.1-201
ENST00000611352
97 nt
BASIC
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□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-1327P-201
ENST00000365302
105 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
SNORD110-201
ENST00000408189
75 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-402P-201
ENST00000410678
103 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
Y_RNA.620-201
ENST00000411009
88 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
AC006210.1-201
ENST00000424882
111 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
HMGN2P22-201
ENST00000427588
175 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-848P-201
ENST00000515948
107 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-617P-201
ENST00000516147
107 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-473P-201
ENST00000516164
107 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-1049P-201
ENST00000516414
107 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU7-153P-201
ENST00000516455
62 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR5706-201
ENST00000579841
80 nt
BASIC
0.29
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-497P-201
ENST00000365316
104 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MT-TY-201
ENST00000387409
66 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR501-201
ENST00000390204
84 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR5582-201
ENST00000579697
68 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
MIR3140-201
ENST00000583685
90 nt
BASIC
0.28
□□□□□ -2.36
CAPN9
O14815
RNU6-633P-201
ENST00000362612
103 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNA5SP128-201
ENST00000365305
116 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
SNORD116-22-201
ENST00000384430
92 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
AC073261.1-201
ENST00000429409
121 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
FGF7P7-201
ENST00000514120
227 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-1057P-201
ENST00000517162
102 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR4460-201
ENST00000577862
86 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR5190-201
ENST00000581537
80 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
MIR548O2-201
ENST00000616090
70 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
AC069503.3-201
ENST00000618674
145 nt
BASIC
0.27
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
SNORA24B-201
ENST00000384176
131 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
Y_RNA.593-201
ENST00000410292
98 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNA5SP25-201
ENST00000410815
110 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-1052P-201
ENST00000411398
104 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
CAPN9
O14815
RNU6-719P-201
ENST00000516671
104 nt
BASIC
0.26
□□□□□ -2.37
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