Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
TMEM260Q9NX78 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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TMEM260Q9NX78 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
TMEM260Q9NX78 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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TMEM260Q9NX78 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
TMEM260Q9NX78 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
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TMEM260Q9NX78 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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TMEM260Q9NX78 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TMEM260Q9NX78 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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TMEM260Q9NX78 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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TMEM260Q9NX78 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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TMEM260Q9NX78 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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TMEM260Q9NX78 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TMEM260Q9NX78 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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