Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GJB4Q9NTQ9 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.88□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GJB4Q9NTQ9 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GJB4Q9NTQ9 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GJB4Q9NTQ9 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GJB4Q9NTQ9 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GJB4Q9NTQ9 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GJB4Q9NTQ9 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GJB4Q9NTQ9 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GJB4Q9NTQ9 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324 ms