Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
MLC1Q15049 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
MLC1Q15049 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
MLC1Q15049 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms