Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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SNX17Q15036 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SNX17Q15036 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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SNX17Q15036 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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SNX17Q15036 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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SNX17Q15036 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
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SNX17Q15036 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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SNX17Q15036 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNX17Q15036 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNX17Q15036 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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