Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
SCN5AQ14524 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SCN5AQ14524 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
SCN5AQ14524 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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