Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
MRPL49Q13405 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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MRPL49Q13405 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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MRPL49Q13405 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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MRPL49Q13405 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
MRPL49Q13405 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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MRPL49Q13405 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
MRPL49Q13405 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
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