Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SH3BP1Q9Y3L3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP1Q9Y3L3 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.3 ms