Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
DLL3Q9NYJ7 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
DLL3Q9NYJ7 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
DLL3Q9NYJ7 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.2 ms