Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU5B-6P-201ENST00000516765 68 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.7 ms