Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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USP49Q70CQ1 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
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USP49Q70CQ1 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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USP49Q70CQ1 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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USP49Q70CQ1 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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USP49Q70CQ1 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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USP49Q70CQ1 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
USP49Q70CQ1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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USP49Q70CQ1 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
USP49Q70CQ1 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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