Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.73□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
CNGA3Q16281 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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CNGA3Q16281 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
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CNGA3Q16281 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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CNGA3Q16281 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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CNGA3Q16281 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CNGA3Q16281 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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CNGA3Q16281 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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CNGA3Q16281 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CNGA3Q16281 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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