Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RAPGEF1Q13905 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RAPGEF1Q13905 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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