Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
KLF9Q13886 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
KLF9Q13886 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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