Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
PDE3BQ13370 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
PDE3BQ13370 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE3BQ13370 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE3BQ13370 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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