Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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FOXF1Q12946 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
FOXF1Q12946 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
FOXF1Q12946 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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