Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-3.99□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-4□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-4.01□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-4.01□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-4.03□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 MIR124-1-201ENST00000385275 85 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-4.09□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
NRXN3Q9Y4C0 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.3 ms