Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
FOXQ1Q9C009 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
FOXQ1Q9C009 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXQ1Q9C009 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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