Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TRIM63Q969Q1 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TRIM63Q969Q1 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
TRIM63Q969Q1 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRIM63Q969Q1 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
TRIM63Q969Q1 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.1 ms