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Protein–RNA interactions for Protein: Q16586
SGCA, Alpha-sarcoglycan, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SGCA
Q16586
RNU6-850P-201
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
AP002392.1-201
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208 nt
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
CYP19A1-220
ENST00000613097
123 nt
TSL 5
BASIC
-0.31
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
MIR148A-201
ENST00000362215
68 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
Y_RNA.270-201
ENST00000364693
104 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
SNORD114-12-201
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75 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
MIR516B1-201
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90 nt
BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
RNU7-6P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
AC141273.2-201
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130 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
AC087741.2-201
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BASIC
-0.32
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
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97 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
SNORD115-18-201
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82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
SNORD115-17-201
ENST00000364612
82 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
RNU1-141P-201
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158 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
Y_RNA.342-201
ENST00000365352
113 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
Y_RNA.489-201
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101 nt
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
AC040936.1-201
ENST00000534543
172 nt
TSL 5
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
hsa-mir-3130-1.1-201
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75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
NFIA-AS1-206
ENST00000630199
220 nt
TSL 5
BASIC
-0.33
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
Y_RNA.35-201
ENST00000362601
101 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
RNU4-11P-201
ENST00000365287
132 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
MIR106A-201
ENST00000384870
81 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
RNU6-1135P-201
ENST00000411083
103 nt
BASIC
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□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
AL357793.1-201
ENST00000448412
401 nt
TSL 5
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
RNA5SP285-201
ENST00000516619
119 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
RNU6-521P-201
ENST00000516663
105 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
MIR3163-201
ENST00000581592
73 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
Y_RNA.773-201
ENST00000607168
90 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
MIR6759-201
ENST00000638110
65 nt
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
CCDC7-215
ENST00000639629
4158 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
-0.34
□□□□□ -2.46
SGCA
Q16586
SNORD115-44-201
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82 nt
BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
Y_RNA.441-201
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112 nt
BASIC
-0.35
□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
SNORD38.2-201
ENST00000384470
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
MIR516A2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
MIR516A1-201
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90 nt
BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
MT-TI-201
ENST00000387365
69 nt
BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
AC109327.2-201
ENST00000448339
378 nt
BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
RNU6-861P-201
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106 nt
BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
MIR548AG2-201
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BASIC
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SGCA
Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
Y_RNA.662-201
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BASIC
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Q16586
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SGCA
Q16586
MIR3121-201
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77 nt
BASIC
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SGCA
Q16586
MIR4473-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
AC021753.1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
RNU6-915P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
RNU6-463P-201
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BASIC
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Q16586
MIR617-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
RNU6-460P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
RNU7-120P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
RNU6-682P-201
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SGCA
Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
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Q16586
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Q16586
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BASIC
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Q16586
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BASIC
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Q16586
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Q16586
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BASIC
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Q16586
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Q16586
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□□□□□ -2.47
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Q16586
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Q16586
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SGCA
Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
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SGCA
Q16586
MIR759-201
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BASIC
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SGCA
Q16586
RNU6-1254P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.47
SGCA
Q16586
RNU6-320P-201
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BASIC
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SGCA
Q16586
RNU7-188P-201
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SGCA
Q16586
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SGCA
Q16586
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BASIC
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Q16586
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SGCA
Q16586
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SGCA
Q16586
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BASIC
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Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
RNU6-138P-201
ENST00000515952
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SGCA
Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.48
SGCA
Q16586
MIR4460-201
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BASIC
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□□□□□ -2.48
SGCA
Q16586
uc_338.10-201
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BASIC
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Q16586
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BASIC
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Q16586
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Q16586
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107 nt
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Q16586
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BASIC
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SGCA
Q16586
U8.6-201
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BASIC
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Q16586
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BASIC
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□□□□□ -2.48
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Q16586
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Q16586
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Q16586
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113 nt
BASIC
-0.43
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Q16586
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Q16586
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Q16586
Y_RNA.552-201
ENST00000384665
112 nt
BASIC
-0.43
□□□□□ -2.48
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