Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SGCBQ16585 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SGCBQ16585 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SGCBQ16585 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SGCBQ16585 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.7 ms