Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDGFRLQ15198 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDGFRLQ15198 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDGFRLQ15198 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDGFRLQ15198 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDGFRLQ15198 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
PDGFRLQ15198 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
PDGFRLQ15198 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDGFRLQ15198 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
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