Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
LAPTM4AQ15012 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LAPTM4AQ15012 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
LAPTM4AQ15012 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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