Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3AQ14563 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3AQ14563 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3AQ14563 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3AQ14563 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3AQ14563 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SEMA3AQ14563 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SEMA3AQ14563 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SEMA3AQ14563 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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