Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
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GBX1Q14549 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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GBX1Q14549 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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GBX1Q14549 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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GBX1Q14549 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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GBX1Q14549 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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GBX1Q14549 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
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GBX1Q14549 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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GBX1Q14549 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
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GBX1Q14549 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
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GBX1Q14549 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GBX1Q14549 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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GBX1Q14549 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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GBX1Q14549 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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GBX1Q14549 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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GBX1Q14549 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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GBX1Q14549 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
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GBX1Q14549 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
GBX1Q14549 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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