Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
KLF9Q13886 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KLF9Q13886 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KLF9Q13886 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
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