Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP140Q13342 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP140Q13342 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP140Q13342 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP140Q13342 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP140Q13342 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP140Q13342 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
SP140Q13342 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP140Q13342 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP140Q13342 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SP140Q13342 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SP140Q13342 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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SP140Q13342 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
SP140Q13342 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SP140Q13342 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SP140Q13342 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SP140Q13342 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SP140Q13342 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SP140Q13342 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
SP140Q13342 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SP140Q13342 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SP140Q13342 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SP140Q13342 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SP140Q13342 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SP140Q13342 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SP140Q13342 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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SP140Q13342 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SP140Q13342 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SP140Q13342 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SP140Q13342 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SP140Q13342 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SP140Q13342 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SP140Q13342 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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SP140Q13342 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SP140Q13342 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SP140Q13342 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SP140Q13342 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SP140Q13342 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SP140Q13342 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SP140Q13342 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SP140Q13342 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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