Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RPA4Q13156 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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RPA4Q13156 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RPA4Q13156 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.79□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RPA4Q13156 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
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