Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN4O14493 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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CLDN4O14493 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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CLDN4O14493 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
CLDN4O14493 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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CLDN4O14493 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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CLDN4O14493 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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CLDN4O14493 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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CLDN4O14493 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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CLDN4O14493 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CLDN4O14493 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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