Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
GGA3Q9NZ52 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GGA3Q9NZ52 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GGA3Q9NZ52 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GGA3Q9NZ52 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
GGA3Q9NZ52 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.4 ms