Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.08□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
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