Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNF548Q8NEK5 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
ZNF548Q8NEK5 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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