Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SMC1AQ14683 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SMC1AQ14683 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SMC1AQ14683 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SMC1AQ14683 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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