Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
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GBX1Q14549 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
GBX1Q14549 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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GBX1Q14549 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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GBX1Q14549 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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GBX1Q14549 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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GBX1Q14549 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GBX1Q14549 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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