Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 RNU6ATAC14P-201ENST00000516218 91 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NFX1Q12986 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NFX1Q12986 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NFX1Q12986 RNU6-724P-201ENST00000390958 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NFX1Q12986 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NFX1Q12986 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NFX1Q12986 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NFX1Q12986 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NFX1Q12986 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NFX1Q12986 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NFX1Q12986 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFX1Q12986 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFX1Q12986 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFX1Q12986 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NFX1Q12986 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFX1Q12986 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFX1Q12986 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NFX1Q12986 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NFX1Q12986 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NFX1Q12986 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NFX1Q12986 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFX1Q12986 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFX1Q12986 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NFX1Q12986 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.3 ms