Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PRPF18Q99633 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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PRPF18Q99633 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PRPF18Q99633 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PRPF18Q99633 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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