Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK5Q16478 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
GRIK5Q16478 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
GRIK5Q16478 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
GRIK5Q16478 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1460.2 ms